Pasca kemerdekaan tantangan pesantren semakin tampak jelas dan terus berlanjut sampai pada era globalisasi di mana teknologi semakin maju dan tantangan pesantren semakin berat. Perkembangan ilmu pengetahuan dan teknologi, sistem informasi, dunia kerja, isu-isu demokrasi, hak azasi manusia, jender, multikulturalisme sampai isu-isu lain, itu semua menjadi tantangan yang perlu dijawab dan disikapi dunia pesantren agar tetap eksis dan survive di tengah derasnya arus global sekarang ini. Oleh karena itu, dinamika pesantren masa depan tidak bisa dipisahkan dari proses globalisasi. Sebaliknya justru eksistensi pesantren masa depan sangat ditentukan oleh kemampuannya berintegrasi secara kultural dengan sistem internasional yang ditandai dengan tata hubungan yang semakin rasional, dinamis, dan kompetitif. Maka jelas, bahwa keniscayaan untuk mengadakan pembaharuan dalam berbagai macam aspek tidak bisa ditolelir lagi bagi pesantren sebelum mengetahui lebih jauh peluang atau kemungkinan pesantren menjadi “centre of excellence” bagi pengembangan sains dan teknologi. Lantas bagaimanakah strategi pesantren agar tetap eksis dan bertahan di era globalisasi sehingga menjadi pesantren Idaman Masa Depan.